Rendimiento del Panel de Neumonía FilmArray® comparado con Cultivo Bacteriano en pacientes a los que se les solicitaron ambos métodos de diagnóstico
Barra lateral del artículo
Contenido principal del artículo
Resumen
Introducción: La neumonía es una de las infecciones más frecuentes con mayor tasa de mortalidad y morbilidad, y el objetivo de este estudio fue evaluar la utilidad diagnóstica del FilmArray® Pneumonia Panel (FPP) en la detección de una amplia gama de patógenos, incluidas 15 especies bacterianas, en muestras obtenidas de lavado broncoalveolar (BAL) y secreciones orotraqueales (OTS). Materiales y métodos: Se recogieron 190 muestras respiratorias de pacientes a los que se les realizó tanto la prueba de FPP como el cultivo. Se realizaron procedimientos de laboratorio estándar, incluida la tinción de Gram y el recuento bacteriano cuantitativo, en varios medios de agar. Los microorganismos se identificaron utilizando el sistema Vitek-MS y se realizaron pruebas de susceptibilidad de acuerdo con las directrices del Clinical and Laboratory Standards Institute. Resultados: Los microorganismos detectados con mayor frecuencia fueron Pseudomonas aeruginosa, Staphylococcus aureus y Klebsiella pneumoniae. El FPP demostró una alta sensibilidad (95%) pero una menor especificidad (48%) que el cultivo. El panel detectó más patógenos, incluidos Acinetobacter calcoaceticusbaumannii y Streptococcus agalactiae, e identificó los genes de resistencia a los antibióticos KPC y VIM, lo que proporcionó información valiosa sobre la resistencia a los patógenos. Discusión: La prueba FPP es una herramienta de diagnóstico prometedora para identificar patógenos respiratorios y genes de resistencia a los antimicrobianos en pacientes con neumonía. La prueba FPP demostró una alta sensibilidad, lo que puede reducir significativamente el tiempo necesario para el diagnóstico y las decisiones de tratamiento. Sin embargo, su menor especificidad indica que debe usarse junto con el cultivo para confirmar los resultados y prevenir el sobrediagnóstico.
Detalles del artículo
Citas
Infección Respiratoria Aguda. Instituto Nacional de Salud. Colombia: 2020. Available from: https://www.ins.gov.co/buscadoreventos/Informesdeevento/INFECCI%C3%93N%20RESPIRATORIA%20AGUDA_2020.pdf Consultation date: March 2024
Safiri S, Mahmoodpoor A, Kolahi AA, Nejadghaderi SA, Sullman MJM, Mansournia MA, et al. Global burden of lower respiratory infections during the last three decades. Front Public Health. 2023;9: 1-10. https://doi.org/10.3389/fpubh.2022.1028525
Boletín Técnico Estadísticas Vitales (EEVV). DANE 2022. Available from: https://www.dane.gov.co/files/investigaciones/poblacion/bt_estadisticasvitales_defunciones_IItrim_2022pr.pdf Consultation date: March 2024
Vila Estapé J, Zboromyrska Y, Vergara Gómez A, Alejo Cancho I, Rubio García E, Álvarez-Martínez MJ, et al. Molecular diagnostic methods of respiratory infections. Has the scheme diagnosis changed? Enfermedades Infecciosas y Microbiología Clínica. 2016; 34: 40-6. https://doi.org/10.1016/S0213-005X(16)30218-X
BioFire [Internet]. Biofire FilmArray Panels. [cited 2024 June 9]. Available from: https:// www. biofi redx. com/ products/ the- filmarray- panels/filmarray-pneumonia/. Consultation date: June 2024
Eshwara VK, Mukhopadhyay C, Rello J. Community-acquired bacterial pneumonia in adults: An update. Indian Journal of Medical Research. 2020; 151 (4): 287- 02. https://doi.org/10.4103/ijmr.IJMR_1678_19
Amy L. Leber. Respiratory Tract Cultures. In Clinical Microbiology Procedures Handbook, American Society for Microbiology. 2016;3. https://doi.org/10.1128/9781555818814
CLSI. Performance Standards for Antimicrobial Susceptibility Testing. 31 ed. CLSI supplement M100. Clinical and Laboratory Standards Institute. 2021. Consultation date: March 2024
Saldias, F, Diaz O. Community-acquired pneumonia assessment and management in the adult population. Revista Médica Clínica Las Condes. 2014; 25 (3): 553-64. https://doi.org/10.1016/S0716-8640(14)70070-7/
Buchan BW, Windham S, Balada-Llasat J, Leber A, Harrington A, Relich R, et al. Practical comparison of the BioFire FilmArray pneumonia panel to routine diagnostic methods and potential impact on antimicrobial stewardship in adult hospitalized patients with lower respiratory tract infections. Journal of Clinical Microbiolog. 2020; 58 (7): 1- 21. https://doi.org/10.1128/JCM.00135-20
Ginocchio C, Garcia-Mondragon C, Mauerhofer B et al. Multinational evaluation of the BioFire® FilmArray® Pneumonia plus Panel as compared to standard of care testing. European Journal of Clinical Microbiology & Infectious Diseases. 2021; 40 (8): 1609-22. https://doi.org/10.1007/s10096-021-04195-5
Yoo I Y, Huh K, Shim H J, Yun S A, Chung Y N, Kan, O K et al. Evaluation of the BioFire FilmArray Pneumonia Panel for rapid detection of respiratory bacterial pathogens and antibiotic resistance genes in sputum and endotracheal aspirate specimens. International Journal of Infectious Diseases. 2020; 95: 326-31. https://doi.org/10.1016/j.ijid.2020.03.024
Edin A, Eilers H, Allard A. Evaluation of the Biofire Filmarray Pneumonia panel plus for lower respiratory tract infections. Infectious Diseases. 2020; 52(7): 479-88. https://doi.org/10.1080/23744235.2020.1755053
Mitton B, Rule R, Said M. Laboratory evaluation of the BioFire FilmArray Pneumonia plus panel compared to conventional methods for the identification of bacteria in lower respiratory tract specimens: a prospective cross-sectional study from South Africa. Diagnostic Microbiology and Infectious Disease. 2021;99(2):115236. https://doi.org/10.1016/j.diagmicrobio.2020.115236
Gastli N, Loubinoux J, Daragon M, Lavigne JP, Saint-Sardos P, Pailhories H, et al. Multicentric evaluation of BioFire FilmArray Pneumonia Panel for rapid bacteriological documentation of pneumonia. Clin Microbiol Infect. 2021;27(9):1308-14. https://doi.org/10.1016/j.cmi.2020.11.014
Srivastava S, Sharad N, Kiro V, Ningomban A, Farooque K, Mathur P, et al. Utility of a multiplex pathogen detection system directly from respiratory specimens for treatment and diagnostic stewardship. Microbiology Spectrum. 2024;12(6):1-9. https://doi.org/10.1128/spectrum.03759-23
Peter H. Gilligan, Kevin Alby, Mary K. York. Lower Respiratory Tract Cultures. Clinical microbiology procedure Handbook. Editor in chief Amy L. Leber. American Society for Microbiology. ASM Press. 4th Ed. USA. 2016.
FilmArray® Pneumonia Panel (Instrucciones del Inserto): Biofire Biomerieux. RFIT-PRT-0577-01. November 2018. Consultation date: March 2024
Kamel N, Alshahrani M, Aboshanab K, Borhamy M. Evaluation of the Biofire FilmArray pneumonia panel plus to the conventional diagnostic methods in determining the microbiological etiology of hospital-acquired pneumonia. Biology. 2022;11( 3): 1-12. https://doi.org/10.3390/biology11030377
Kosai K, Akamatsu N, Ota K, Mitsumoto-Kaseida F, Sakamoto K, Hasegawa H, et al. BioFire FilmArray Pneumonia Panel enhances detection of pathogens and antimicrobial resistance in lower respiratory tract specimens. Annals of Clinical Microbiology and Antimicrobials. 2022; 21(1):21-24. https://doi.org/10.1186/s12941-022-00512-8
Moy A, Kimmoun A, Merkling T, Bercot B, Camelena F, Poncin T, et al. Performance evaluation of a PCR panel (FilmArray® Pneumonia Plus) for detection of respiratory bacterial pathogens in respiratory specimens: A systematic review and meta-analysis. Anaesthesia Critical Care & Pain Medicine. 2023; 42(6): 1-10. https://doi.org/10.1016/j.accpm.2023.101300
Murphy C, Fowler R, Balada-LLasat J, Carrol A, Stone H, Akerele O, et al. Multicenter evaluation of the BioFire FilmArray pneumonia/pneumonia plus panel for detection and quantification of agents of lower respiratory tract infection. Journal of Clinical Microbiology, 2020; 58(7): 1-20. https://doi.org/10.1128/JCM.00128-20
Camelena F, Poncin T, Dudoignon E, Salmona M, Le Goff J, Donay J, et al. Rapid identification of bacteria from respiratory samples of patients hospitalized in intensive care units, with FilmArray Pneumonia Panel Plus. International Journal of Infectious Diseases. 2021;108: 568-573. https://doi.org/10.1016/j.ijid.2021.05.074